Der maritime Vorteil von Šibenik ist geografisch bedingt: Die Stadt liegt an der Mündung des Krka-Ästuars, 11 Seemeilen vom äußeren Rand des Kornati-Archipels entfernt und in unmittelbarer Nähe zu 140 kartierten Inseln, von denen die meisten unbewohnt sind.
Das Šibenik-Archipel umfasst 249 Quadratkilometer befahrbares Wasser, verstreute Kalksteinformationen und geschützte Kanäle, die bereits seit der Zeit, als illyrische Händler im 4. Jahrhundert v. Chr. die Route nach Zadar kartierten, dem Küstenverkehr dienen. Im Mittelalter nutzten venezianische Galeeren die natürlichen Häfen des Archipels als Zwischenstopps für Konvois in Richtung Osten, und die habsburgische Marine kartierte die Untiefen zwischen 1867 und 1914 detailliert. Heute befahren private Charterboote, die von der Šibenska riva ablegen, dieselben Kanäle und ermöglichen den Zugang zu Orten, die auf dem Landweg nicht erreichbar sind.
Die Blaue Lagune auf Krknjaši Veli, ein von Karstfelsen umgebenes und durch unterirdische Quellen gespeistes Gezeitenbecken, wurde 1982 zu einem planmäßigen Stopp für Ausflugsboote, nachdem lokale Betreiber das Interesse von Schwimmern an geschütztem, durchscheinendem Wasser erkannten. Die Tiefe der Lagune beträgt durchschnittlich 3,2 Meter, und ihr Kalksteinboden reflektiert das Mittagssonnenlicht in Abstufungen von Türkis bis Kobalt. Südlich der Lagune umschließt die Grenze des Nationalparks Kornaten 89 Inseln auf 220 Quadratkilometern – das nach Flächendichte dichteste Archipel des Mittelmeers. Parkvorschriften verbieten das Ankern in ausgewiesenen Zonen, erlauben jedoch die Durchfahrt und das Schwimmen an 14 genehmigten Standorten, die alle mit privaten Booten erreichbar sind.
Eine private Bootstour in Šibenik führt in der Regel durch den Murter-Kanal, vorbei an Zlarin und Prvić, bevor das äußere Archipel erreicht wird. Zlarin, historisch für den Korallenfang bekannt, liegt 6,5 Seemeilen vom Festland entfernt; Prvić 7 Seemeilen. Beide Inseln bewahren aus der venezianischen Zeit stammende Wachtürme aus Stein, die vom offenen Wasser aus sichtbar sind. Die Charter-Routen reichen von vierstündigen Blaue-Lagune-Rundfahrten bis hin zu ganztägigen Kornati-Transits, mit Abfahrtszeiten zwischen 09:00 und 11:00 Uhr, um den Gezeitenzugang zu optimieren und den Nachmittagswind zu minimieren. Die Saison läuft von April bis Oktober, wobei der Juli und August das höchste Charteraufkommen verzeichnen. Zu den Booten, die von der Šibenska riva aus operieren, gehören Festrumpfschlauchboote, traditionelle hölzerne Gajetas und moderne Katamarane, die meist 8 bis 12 Passagiere befördern. Die Betreiber stellen Schnorchelausrüstung, Mahlzeiten an Bord und Parkeintrittsgenehmigungen als Teil der Standardpakete zur Verfügung, allerdings müssen Schwimmer ihre eigenen Handtücher und Sonnenschutzmittel mitbringen.
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